Horizon O — Bases de connaissances théoriques

Biodiversité fonctionnelle et compartiments écologiques de la ferme

Toute la biodiversité d'une exploitation n'a pas le même statut : une orchidée protégée et un lombric commun n'appellent ni le même regard, ni la même gestion. Cette leçon distingue biodiversité remarquable et biodiversité ordinaire, et situe chacune aux trois échelles spatiales de la ferme.

📊 Bloc-diagramme 3D 🗺️ Cartographie fonctionnelle ⏱️ ~30 min

Savoir

Deux biodiversités, trois échelles

Biodiversité remarquable vs biodiversité ordinaire

La biodiversité remarquable (ou patrimoniale) regroupe les espèces à statut de conservation notable : rares, protégées réglementairement, ou emblématiques d'un habitat (ex. la Cistude d'Europe des Étangs de Beauchêne). Sa valeur est avant tout patrimoniale et réglementaire.

La biodiversité ordinaire (ou fonctionnelle) regroupe les espèces communes — vers de terre, carabes, pollinisateurs sauvages, oiseaux des jardins — qui rendent des services écosystémiques mesurables sans bénéficier d'aucun statut de protection. Sa valeur est fonctionnelle : c'est elle qui fait le travail agronomique quotidien (structuration du sol, régulation des ravageurs, pollinisation).

Vigilance épistémologique

Un diagnostic biodiversité qui ne recense que les espèces protégées donne une vision tronquée de la santé écologique d'une exploitation. La biodiversité ordinaire, invisible et non protégée, conditionne pourtant l'essentiel des services rendus au système de production.

Trois échelles spatiales sur l'exploitation

Intra-parcellaire — à l'intérieur même de la culture : micro-organismes du sol, adventices, arthropodes vivant au cœur de la parcelle.
Inter-parcellaire — les liaisons entre parcelles : haies, bandes enherbées et autres infrastructures agroécologiques (IAE) qui connectent les milieux.
Paysagère — le contexte territorial : matrice bocagère, massifs forestiers limitrophes, réseau hydrographique — qui détermine la capacité de dispersion des espèces à l'échelle du bassin versant.

Fig. 1 — Les trois échelles de biodiversité, en anneaux concentriques : du cœur de la parcelle jusqu'au paysage qui l'englobe.

Zone de refuge et zone de prédation

À l'échelle inter-parcellaire, une haie fonctionne comme zone de refuge pour les auxiliaires de cultures (carabes, syrphes, chauves-souris), qui rayonnent ensuite vers le cœur de parcelle — zone de prédation — pour y réguler les ravageurs. Cette pression de prédation décroît avec la distance à la haie : c'est un argument agronomique direct en faveur du maillage bocager, indépendamment de toute considération patrimoniale.

Haie bocagère en bordure de parcelle — Une haie bocagère réelle, en bordure de parcelle (Avesnois) — c'est ce type de structure qui fonctionne comme zone refuge. Photo : Vinz1234, Wikimedia Commons, licence CC BY-SA 3.0.

Fig. 2 — Décroissance de la densité d'auxiliaires prédateurs avec la distance à une haie refuge (représentation en classes de distance plutôt qu'en gradient continu, pour une lecture quantitative plus rigoureuse).

Coléoptère carabique (Carabidae) — Un coléoptère carabique (famille Carabidae) — auxiliaire prédateur type de la biodiversité ordinaire, hébergé par la haie et actif au sol dans la zone de prédation. Photo : Wikimedia Commons, licence CC BY-SA 3.0.

Étude de cas

Inventaire à trois échelles — GAEC des Trois Sources

Relevé de terrain (bassin versant du Rollon)

Échelle	Élément observé	Statut
Intra-parcellaire	Vers de terre anéciques (galeries verticales)	Ordinaire
Intra-parcellaire	Cortège d'adventices messicoles en bordure	Ordinaire
Inter-parcellaire	2,3 km de haies bocagères multi-étagées	Ordinaire
Inter-parcellaire	Carabes et syrphes recensés en lisière de haie	Ordinaire
Paysagère	Corridor humide reliant le GAEC aux Étangs de Beauchêne	Remarquable
Paysagère	Présence occasionnelle de Cistude d'Europe en zone humide connexe	Remarquable

L'essentiel du relevé relève de la biodiversité ordinaire — c'est elle qui structure le sol et régule les ravageurs au quotidien. La biodiversité remarquable, ici liée à la continuité écologique vers Beauchêne, justifie en plus une vigilance réglementaire (Natura 2000) sur les aménagements du corridor.

Cistude d'Europe (Emys orbicularis) — La Cistude d'Europe (*Emys orbicularis*), espèce de biodiversité remarquable, protégée au titre de la Directive Habitats-Faune-Flore (annexes II et IV) — présente dans le corridor humide reliant le secteur à Beauchêne. Photo : Wikimedia Commons, licence CC BY-SA 4.0.

Savoir-être

Ne pas hiérarchiser la biodiversité par son seul capital symbolique

Accorder autant d'attention méthodologique à un cortège de carabes ordinaires qu'à une espèce protégée : leur valeur n'est pas de même nature, mais aucune n'est négligeable.
Résister au biais qui consiste à ne documenter que ce qui est photogénique ou réglementairement contraignant.
Expliquer à l'exploitant la valeur agronomique concrète de la biodiversité ordinaire — un argument souvent plus mobilisateur qu'un argument patrimonial abstrait.

Savoir-faire

Cartographier les trois échelles de biodiversité d'une exploitation

Échelle intra-parcellaire : test bêche pour la macrofaune du sol, relevé rapide des adventices en plein champ.
Échelle inter-parcellaire : cartographie du linéaire de haies et autres IAE à partir du parcellaire, localisation des zones de refuge potentielles.
Échelle paysagère : lecture d'une photo aérienne ou du cadastre pour situer l'exploitation dans la matrice bocagère et repérer les corridors de connexion vers des espaces protégés voisins.
Croisement des échelles : superposer les trois relevés pour identifier les discontinuités (ex. un tronçon de haie manquant qui coupe un corridor).

Erreurs fréquentes

Pièges à éviter

Limiter le diagnostic biodiversité aux espèces protégées, en ignorant la biodiversité ordinaire qui rend l'essentiel des services écosystémiques.

Analyser une exploitation à une seule échelle (souvent la parcelle) sans resituer les IAE dans leur continuité paysagère.

Considérer qu'une pression de prédation par les auxiliaires est uniforme sur toute la parcelle, alors qu'elle décroît avec la distance à la zone refuge.

Évaluation

Quiz de synthèse

Auto-positionnement

Pour chaque compétence, positionnez-vous honnêtement — cela ne sera pas noté, mais orientera vos révisions.

Annexe A1.1.3

Grille de classification — remarquable / ordinaire × 3 échelles

Grille à utiliser pour classer les éléments observés lors d'un relevé de terrain, avant toute synthèse.

Élément observé	Échelle	Statut
___________________________	Intra-parcellaire	Remarquable / Ordinaire
___________________________	Inter-parcellaire	Remarquable / Ordinaire
___________________________	Paysagère	Remarquable / Ordinaire

Usage recommandé

Renseigner d'abord l'échelle et le statut pour chaque élément avant de rédiger une synthèse — cela évite de mélanger les deux logiques (spatiale et patrimoniale) dans une même phrase de diagnostic.

Sources bibliographiques

Pour aller plus loin

Burel, F. & Baudry, J. (1999). Écologie du paysage : concepts, méthodes et applications. Éditions TEC & DOC.
Landis, D. A., Wratten, S. D., & Gurr, G. M. (2000). Habitat management to conserve natural enemies of arthropod pests in agriculture. Annual Review of Entomology, 45, 175-201. — référence fondatrice sur le rôle des haies et bandes refuges dans la régulation biologique.
Duru, M. et al. (2015). How to implement biodiversity-based agriculture to enhance ecosystem services: a review. Agronomy for Sustainable Development, 35(4), 1259-1281.
Directive 92/43/CEE dite « Habitats-Faune-Flore », annexes II et IV — statut de protection de la Cistude d'Europe (Emys orbicularis).
Arrêté du 8 janvier 2021 fixant la liste des amphibiens et des reptiles protégés sur l'ensemble du territoire français.